保罗又回到大马士革，大胆奉耶稣的名讲道。犹太人无法抵挡他论据中的智慧，于是他们商议要用武力——一个衰败的事业仅存的手段——来止息他的声音。他们决定要制死他。保罗得悉他们的毒计，各城门都被他们日夜严密地看守着，为要防止他逃脱。门徒所感到的焦虑使他们到上帝跟前祈祷；他们因为要设法给这蒙主选召的使徒找一条出路，甚少睡眠。他们终于想出办法在夜间用筐子把他由一家人的窗户里从城墙上缒下去。保罗就以这种狼狈的方式出了大马士革。
这时他便前往耶路撒冷去，希望在那里和使徒们相识，特别要见见彼得。他急欲会见那些曾经在地上和基督住在一起，一同祈祷，并当面谈话的加利利渔夫们。他也特别希望能会见那在众使徒中居首的一位。当保罗走进耶路撒冷时，他对那城市和圣殿的看法不同了，他这时已经知道上帝报应的刑罚就要临到。
犹太人因保罗的悔改感到无限的悲愤和恼怒。他则坚如磐石，并且过于乐观地幻想，他向他的朋友们讲说他奇妙的经验之后，他们必要像他一样，改变他们的信仰相信耶稣。他过去反对基督和基督的信徒，完全是出于忠诚，在他半途受阻，觉悟己罪之后便立即离弃了邪恶的道路而接受了耶稣的信仰。所以这时他确信，当他的朋友们和早年的同事一听到他奇妙转变的事实经过，又看到他不再是先前一样骄傲的法利赛人，又不再逼迫并杀害信耶稣为上帝儿子的人，他们也会看出自己的错误并投入信徒的行列。
保罗试图与他的弟兄，就是其他的门徒联合，但发觉他们不肯接纳他为他们的一分子，故此大为悲伤失望。他们还记得他过去怎样逼迫过他们，所以怀疑他是伪装，要欺骗并消灭他们。他们固然听到他奇妙的悔改，但因他立刻退到亚拉伯去，他们没有再听到有关他的确实消息，故此，他们对他大转变的传说，不敢相信。
【与彼得和雅各会面】
巴拿巴曾经慷慨地把自己的金钱捐出来维持基督的事业，并补助穷人的需要。他过去在保罗反对信徒的时候也是与他相识的。这时他便前来恢复从前的友谊，并听保罗对于自己神妙的转变和以后一段经验的见证。他完全相信并接纳了保罗，并握住他的手，把他带到使徒面前。巴拿巴向他们述说了他刚听到的经验——耶稣曾在保罗到大马士革去的时候亲自向他显现，并曾对他说话；后来保罗曾因亚拿尼亚的祈祷而重见光明，随即在城中各会堂里讲说耶稣为上帝的儿子。
使徒们不再犹豫了，他们不能抵挡上帝。当时在耶路撒冷的只有彼得和雅各，他们便伸出右手与这个一度猛烈逼害他们信仰的人行相交之礼。过去他们怎样惧怕而远避他，这时他们也怎样热爱并尊敬他。这时这个新信仰的两个主要人物见面了——一个是基督在世时蒙召作为他同伴的彼得，一个是在耶稣升天之后与他面对面讲话，并曾在异象中看见他和他在天上所作之工作的保罗。
这头一次的会见对于这两位使徒双方都有很大的作用，可惜见面的时间不长，因为保罗急欲为主作工。过不久那曾经热切地反驳司提反的声音却在同一个会堂里无畏地宣布耶稣为上帝的儿子——在那里倡导司提反用自己的性命所维护的同一事业。他述说了他那奇妙的经验，并以关怀他同胞和从前同事们的满腔热忱从预言中提出凭据，证明那被钉十字架的基督就是上帝的儿子，正像司提反过去所作的一样。
其实保罗把他犹太同胞们的精神估计错了，那从前暴发在司提反头上的愤怒这时便落到保罗身上了。他看出他必须与弟兄们分离因而满心忧伤。他甘愿舍弃生命，只要他的死能帮助他们认识真理。犹太人下手布置阴谋要杀害他，门徒便催他快离开耶路撒冷；但他总留恋不舍得离开，急欲再为他的犹太同胞工作一个时期。他因曾积极参加杀害司提反的事，故此热望勇敢地出来维护司提反所付出生命代价所维护的真理，借此洗除过去的污点。他总觉得逃离耶路撒冷是怯懦的行为。
【逃离耶路撒冷】
当保罗冒险不顾一切后果到圣殿里去恳切祷告上帝时，救主在异象中向他显现说：“你赶紧的离开耶路撒冷，不可迟延，因为你为我作的见证，这里的人必不领受。”保罗这时迟疑，在他使顽固的犹太人信服他所信的真理之前，不愿离开耶路撒冷。他想，纵然他为真理牺牲性命，这也不过偿还了司提反的血债，因为他总认为自己对司提反的死负有责任。他回答说：“主啊，他们知道我从前把信你的人收在监里，又在各会堂里鞭打他们；并且你的见证人司提反被害流血的时候，我也站在旁边欢喜；又看守害死他之人的衣裳。”但主的答复比先前更断然“你去吧，我要差你远远的往外邦人那里去。”
及至弟兄们听到保罗所见的异象，以及上帝对于他所有的照顾时，他们就更为他担心了，因为他们认识到、他确是主所拣选的器皿，要把真理传到外邦去。他们赶紧帮助他秘密逃离耶路撒冷，唯恐犹太人要杀死他。保罗既离开了，犹太人的激烈反对就暂时和缓下来，教会也得到一个平安的时期，那时信徒的人数也不断增加。