洪水泛滥，水势比最高的山还要高出“十五肘”。方舟里面的一家人时常觉得自己总不能免于灭亡，因为他们的船已随波上下五个月之久，显然唯风浪之命是听而飘荡了。这是一个严重的试验，但是挪亚的信心并没有动摇。因为他确信有上帝的手在掌着方舟的舵。
当水势渐落时，上帝使方舟飘流到他所预定的群山之间。这些山岭彼此相距不远，于是方舟徘徊于四山环抱的水港之内，而不再飘荡在无边无际的海洋中了。这给方舟里被暴风催逼而筋疲力尽的人和禽兽，带来了莫大的安慰。
挪亚和他全家，焦急地等着水势退落，因为他们渴望再回到陆地上。在山顶出现之后，过了四十天，他们放出一只乌鸦——一只善于探索的飞鸟出去，要看看地上的水干了没有。那乌鸦只见遍地都是水，并无别物，只在方舟附近飞来飞去。再过七天，挪亚又放出一只鸽子，鸽子找不到落脚之地，仍旧飞回方舟。挪亚再等了七天，重又放出鸽子。到了晚上，鸽子回来，嘴里叼着一片橄榄树的叶子，大家就极其欢喜。然后“挪亚撤去方舟的盖观看，便见地面上干了。”（创8:13）他仍然耐性地在方舟里面等候着。他既然照着上帝的命令进入方舟，所以出去时，也要等待特别的指示。
最后，有一位天使从天上降下，打开方舟的大门，吩咐先祖挪亚和他的全家离舟，并要他们带着一切活物回到陆地上去。挪亚逃离洪水之灾，深自庆幸之余，并没有忘记那位保全他们生命的慈悲的上帝。他离开方舟后的第一件事，便是筑一座坛，献上各样洁净的飞鸟和牲畜为祭，用以表示他感谢上帝拯救的大恩和对伟大的牺牲——基督的信心。上帝悦纳了挪亚的祭物；不但赐福与他和他全家，也赐福与以后一切住在地上的人。“耶和华闻那馨香之气，就心里说，我不再因人的缘故咒诅地，……地还存留的时候，稼穑、寒暑、冬夏、昼夜，就永不停息了。”（创8:21-22）这是给洪水以后各世代人的一个教训。挪亚面临一片荒凉的大地，他在为自己预备住处之前，先为上帝筑了一座祭坛。他所有的牲畜不多，且是付了非常的代价才保存下来的，但他欢欢喜喜地将一部分献给上帝，借以承认万物都是属于上帝的。照样，我们首先应该关心的乃是奉献乐意捐给上帝。我们当用敬拜的行为和推进圣工的捐献，来表示感谢上帝向我们所显示的恩典和慈爱。
上帝唯恐以后遇着乌云四合，大雨下降之际，会使世人因怕洪水再一次泛滥而心惊胆寒，所以就应许挪亚全家，说：“我与你们立约……不再有洪水毁坏地了。……我把虹放在云彩中，这就可作我与地立约的记号了。我使云彩盖地的时候，必有虹现在云彩中，……我看见，就要记念我与地上各样有血肉的活物所立的永约。”（创9:11-16）
上帝这样把美丽的虹放在云中，作为他与世人立约的记号。他的垂顾和他对犯错误之人类的慈心，是何等的大啊！耶和华说：当他看见虹的时候，他必记念他的约。这并不是说他会忘记；乃是他用我们的言语向我们讲话，使我们能更明白他的意思。上帝的旨意：是要在我们后代子孙询问这架在天空中的美丽拱门有什么意义时，父母就要重述洪水的故事；并告诉他们，至高者将虹弯好了放在云彩中，就是应许永不再使洪水在地上泛滥。这虹就要世世代代向人见证神圣之爱，并坚固他们对上帝的信心。
在天上也有仿佛虹的荣光围绕着上帝的宝座；并映照在基督的头顶。先知说：“下雨的日子，云中虹的形状怎样，（宝座）周围光辉的形状也是怎样；这就是耶和华荣耀的形象。”（结1:28）蒙启示的约翰说：“我……见有一个宝座安置在天上，又有一位坐在宝座上，……又有虹围着宝座，好像绿宝石。”（启4:2-3）当人因犯重罪而招致上帝的刑罚时，救主就指着云彩中的虹，并指着宝座周围和自己头顶上的虹，作为上帝向悔改的罪人发怜悯的记号为之代求。
上帝曾亲自将他赐给挪亚有关洪水的保证，和一个最宝贵的、带恩典的应许结合起来说：“我怎样起誓不再使挪亚的洪水漫过遍地，我也照样起誓不再向你发怒，也不斥责你。大山可以挪开，小山可以迁移，但我的慈爱必不离开你，我平安的约也不迁移，这是怜恤你的耶和华说的。”（赛54:9-10）
当挪亚看见凶猛的野兽同他一起从方舟里出来时，他害怕那只有几口人的家会被野兽杀害。于是上帝差遣天使来，送给他仆人一个使他放心的信息，说：“凡地上的走兽，和空中的飞鸟，都必惊恐、惧怕你们。连地上一切的昆虫，并海里一切的鱼，都交付你们的手。凡活着的动物，都可以作你们的食物，这一切我都赐给你们如同菜蔬一样。”（创9:2-3）在以前，上帝并没有允许人吃动物的肉，他的本意是要人完全靠地里的出产维持生活；但如今一切植物既然都已毁灭，所以才允许他们吃那些由方舟保存下来的洁净动物之肉。
洪水之后，整个地面都改变了。因为人犯罪的结果，地受了第三次可怕的咒诅。当洪水渐退时，大小山冈都被一望无际的混浊海水所包围，到处可见人和走兽的尸体。上帝不愿意让这些尸体留在地面上腐烂，致令空气污浊，所以要把它们都埋在地下。为了吹干地上的水，上帝就使大风刮起，这风的暴力激动了水面，甚至把一些山头都冲掉了，将树木、巨石、泥土堆积在尸体之上。在洪水之前，那使世界丰富美丽而被人当作偶像敬拜的金银宝石和贵重的木料，这时也照样被埋在土中不见了，巨大的水力把大石和泥土冲来，堆积在这些宝物之上，甚至有些地方堆成了大山。上帝看出罪人越富足昌盛，他们在他面前也就越发败坏。那些宝物本应使人尊荣厚赐百物的上帝，如今却被拿来当作神明敬拜，而上帝反被他们侮辱轻慢了。
地上呈现出一片无法言喻的荒凉和混乱景象。从前匀称壮丽的山岭如今都崩裂成犬牙交错的了。地面上到处散布着石块和断崖。许多地方原来的大小山冈都不见了，连一点痕迹也找不到；而以前的平原上却出现了重重叠叠的山脉。这种变化在有些地方特别显著。从前盛产金银宝石的地方，所受的咒诅也是最严重的。至于无人居住和邪恶较少的地方，所受的咒诅则较轻了。
这时，从前极大的森林也被埋在地下。后来这些森林成了煤，就是今日广大的煤层，并产生大量的油类。这些煤和油常常在地下自燃。于是岩石受热烧成石灰，铁矿也因而溶化了。水遇石灰的作用，使地下产生更大的热量，由此出现了地震、火山和喷泉等自然现象。当火与水在岩石层或矿穴中接触时，地下就发生猛烈的爆炸，如同隆隆的雷声。于是空气闷热，继而火山喷发；这些极热的物质往往得不到适当的出口，于是地壳震动，地面突起高涨，如同海中的波浪，而后就裂开，将城市、村庄和燃烧着的大山都吞了下去。这些惊人的现象，在基督降临和世界末日前，必要越来越多，越来越可怕。这就是地球即将被毁的预兆。
地的深处乃是耶和华的武库，他曾从其中拿出兵器来，毁灭洪水以前的世界。水曾从地下涌出，连同从天上降下来的雨水，一起完成了毁灭的工作。洪水以后，火也同水一样，曾作上帝毁灭罪恶极大之城邑的工具。上帝降下这些灾难，使轻视他权威并践踏他律法的人，看到他的能力而震惊战栗，从而承认他公义的至尊主权。当世人看到燃烧着的山头倾泻出火焰和熔化的矿质，使河流干涸，城邑灭绝，到处呈现出毁坏和荒凉的景象时，连勇士都要胆颤心惊，以至那些不信和亵渎上帝的人，不得不承认上帝确有无穷的权能。
古时候先知曾提到过这种景象，说：“愿你裂天而降，愿山在你面前震动，好像火烧干柴，又像火将水烧开；使你敌人知道你的名，使列国在你面前发颤。你曾行我们不能预料、可畏的事；那时你降临，山岭在你面前震动。”（赛64:1-3）“耶和华……乘旋风和暴风而来，云彩为他脚下的尘土；他斥责海，使海干了，使一切江河干涸。”（鸿1:3-4）
在基督再来的时候，世人必要看见从来没有见过的可怕现象。“大山因他震动，小山也都消化；大地在他面前突起，世界和住在其间的，也都如此。他发愤恨，谁能立得住呢？他发烈怒，谁能当得起呢？”（鸿1:5-6）“耶和华啊，求你使天下垂，亲自降临，摸山，山就冒烟。求你发出闪电，使他们四散；射出你的箭，使他们扰乱。”（诗144:5-6）
“在天上我要显出奇事，在地下我要显出神迹，有血、有火、有烟雾。”（徒2:19）“又有闪电、声音、雷轰、大地震。自从地上有人以来，没有这样大、这样厉害的地震。”“各海岛都逃避了，众山也不见了，又有大雹子从天落在人身上，每一个约重一他连得。（约九十斤）”（启16:18；20-21）
当天上的闪电和地上的火焰互相接触的时候，众山就要燃烧像火窑一般，并要倾泻出一股炽烈的熔岩洪流，摧毁田园、乡村和城邑。沸腾的熔岩要被倾入江河之中，使众水滚沸。又有非常巨大的力量射出大石，并散布碎石片于地上。河水必要干涸，地必要震动，到处都有可怕的地震和爆炸。
上帝必要这样将恶人从地上除灭。但是义人必会在这惊涛骇浪之中得蒙保存，如同挪亚在方舟里得蒙保存一样。上帝必要作他们的避难所，他们必会在他的翅膀底下得庇护。诗人这样说：“耶和华是我的避难所，你已将至高者当你的居所。祸患必不临到你。”“因为我遭遇患难，他必暗暗地保守我；在他亭子里，把我藏在他帐幕的隐密处。”上帝的应许是：“因为他专心爱我，我就要搭救他。因为他知道我的名，我要把他安置在高处。”（诗91:9，10，14；27:5）